該項(xiàng)目引發(fā)爭(zhēng)議的就是其對(duì)長(zhǎng)江上游珍稀魚(yú)類國(guó)家自然保護(hù)區(qū)的影響。對(duì)此，中科院院士、中科院水生生物所魚(yú)類學(xué)家曹文宣曾公開(kāi)表示，在長(zhǎng)江上游干流能夠?yàn)檎湎　⑻赜恤~(yú)類提供適宜生存的江段，僅剩下國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)這353.16km的一小段了，而 重慶市長(zhǎng)江小南海水利樞紐 壩址，正位于 長(zhǎng)江上游珍稀特有魚(yú)類國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū) 緩沖區(qū)與實(shí)驗(yàn)區(qū)的聯(lián)結(jié)處附近，建成后將淹沒(méi)緩沖區(qū)約70km的江段，占自然保護(hù)區(qū)干流段的1/5。在自然保護(hù)區(qū)內(nèi)興建顯著改變水域生態(tài)的水利工程，是違法行為。

自2009年起，包括山水自然保護(hù)中心、自然之友在內(nèi)的多家民間環(huán)保組織和專家學(xué)者多次明確表達(dá)了反對(duì)修建小南海水電站的立場(chǎng)。 自然之友總干事張伯駒對(duì)21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報(bào)道記者介紹。

環(huán)保部在《批復(fù)》中指出，過(guò)去十年長(zhǎng)江上游珍稀、特有魚(yú)類國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)，因?yàn)榻鹕辰掠我黄诠こ痰冗M(jìn)行過(guò)兩次調(diào)整，已經(jīng)使自然保護(hù)區(qū)功能受到較大影響，未來(lái)該流域的開(kāi)發(fā)必須嚴(yán)格按照主體功能區(qū)定位，嚴(yán)守生態(tài)紅線，切實(shí)嚴(yán)格保護(hù)長(zhǎng)江上游珍稀、特有魚(yú)類國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)。

重慶的替代電力建議方案

在小南海水電站被否之后，重慶怎么辦？

此前，重慶市市長(zhǎng)黃奇帆2012年曾在小南海水電站奠基暨 三通一平 工程開(kāi)工儀式上表示，小南海水電站建成后，將發(fā)揮巨大綜合效益，其中電力保障作用突出，年發(fā)電量超過(guò)100億千瓦時(shí)，相當(dāng)于重慶現(xiàn)有年用電量的15%，每年可節(jié)約原煤500多萬(wàn)噸，不僅可以緩解重慶能源緊張狀況，還有助于重慶轉(zhuǎn)變能源發(fā)展方式，形成新的能源保障體系。

對(duì)此，張伯駒建議， 解決重慶電力供應(yīng)，有一系列替代方案值得考慮。其中一個(gè)非?？尚械姆绞绞牵貞c市和三峽集團(tuán)就金沙江下游的四座大壩建立合作共享關(guān)系。重慶可把原本計(jì)劃投資在小南海水電站的投資投在三峽集團(tuán)四座大壩中，從而獲得相應(yīng)比例的所有權(quán)和利益（電能） 。

張伯駒指出，通過(guò)調(diào)整這四個(gè)水庫(kù)的防洪庫(kù)容，利用長(zhǎng)江中游蓄滯洪區(qū)承擔(dān)這一部分洪水風(fēng)險(xiǎn)，三峽集團(tuán)有可能進(jìn)一步提高總的裝機(jī)容量。通過(guò)談判和協(xié)調(diào)，重慶有可能實(shí)現(xiàn)同等投資規(guī)模下更多的水電裝機(jī)容量，解決重慶電力缺口問(wèn)題。而且，四川向家壩水電站經(jīng)重慶至上海的±800千伏直流特高壓輸電線路已經(jīng)進(jìn)行建設(shè)，屆時(shí)重慶市電力輸送能力將大大提高，這為此方案的施行奠定了重要的基礎(chǔ)。

而這一方案對(duì)生態(tài)環(huán)境的益處顯而易見(jiàn)，避免在保護(hù)區(qū)內(nèi)修建大壩，避免對(duì)僅存的長(zhǎng)江珍稀和特有魚(yú)類種群產(chǎn)生負(fù)面影響，也保護(hù)了政府和三峽集團(tuán)將保護(hù)區(qū)作為三峽工程和金沙江下游梯級(jí)工程補(bǔ)償措施的所有投資，同時(shí)也捍衛(wèi)了中國(guó)在長(zhǎng)江流域進(jìn)行可持續(xù)水電開(kāi)發(fā)的宣言。 張伯駒表示。